神道学系では、日本文化の中に脈々と流れ、また本学の建学の精神とも深いかかわりを持つ神道について、歴史や実際の儀礼・実践を踏まえた深みのある研究を行っています。神道系の大学の特色を活かした専門性の高い研究成果を積み重ね、多くの修了生が各地の教育機関などで活躍しています。
　宗教学系では、日本のみならず世界の諸宗教、宗教文化を視野に入れた実証性の高い研究を行っています。特に、現代宗教については特色のある研究成果があります。
　近年、国外からの留学生も増加しており、国際化の時代にふさわしい神道研究、宗教研究ができる専攻分野です。図書館では、関連する古文書類を含めた数多くの資料が利用でき、また研究開発推進機構と連携した調査研究や国際交流には実績があります。
　さらに、首都圏の宗教系大学院との単位互換制度を導入し、多様な宗教について学べるように配慮しています。また、平成23年度から発足した宗教文化士制度に対応できる演習・講義がそろっています。

　◆専攻分野　　　◆授与学位
　　　神道学系　　　　修士(神道学) ／ 博士(神道学)
　　　宗教学系　　　　修士(宗教学) ／ 博士(宗教学)

　文学研究は、國學院の中核的な学問のひとつ。文学専攻は、文献学的方法論や民俗学的方法論などに基づく総合的な文学研究の伝統を受け継ぎ、さらに発展させるために、日本文学、日本語学、中国文学、伝承文学、高度国語・日本語教育の５コースを設けています。
　カリキュラムは、「日本古典研究」や国際的・学際的視点を身につける科目群、企画力と調査方法能力を養成する研究実習科目も取り入れ、グローバル化時代に対応したものとしています。これらを基礎として、各コースでは専門分野から掘り下げて研究を行うことができるように、充実した科目を設置しています。
　文学・民俗学の研究者や中学・高校の教員を数多く輩出してきた伝統と実績を保ちつつ、近年は高い実践力を持つ国語教員や日本語教員の養成も進め、修了後には国内はもとより、タイ・台湾・中国などの大学で教員を務める修了生も輩出しています。

　◆専攻分野　　　　　　　　◆授与学位
　　　日本文学　　　　　　　　　修士(文学) ／ 博士(文学)
　　　日本語学　　　　　　　　　修士(民俗学) ／ 博士(民俗学)
　　　中国文学
　　　伝承文学
　　　高度国語・日本語教育

　多数の専門家を輩出している伝統の日本史学・考古学を軸に、外国史学、美学美術史、博物館学を合わせ５コースを設けています。学生の修学意欲に応えるべく、歴史地理学・文化財学関連科目も揃えてカリキュラムの充実を図っています。平成22年度より、美学美術史と博物館学コースが開設され、多くの学生が学んでいます。加えて、単位互換制度により明治大学・上智大学など他大学大学院の講義も履修可能であるなど、幅広い研究環境を整えています。また、専任の教授に加え、学界第一線の多彩な講師陣、文化財学・博物館学における実務家教員を擁しており、論文作成に専念できる研究指導体制が確立されており、多くの修了生が各地の大学・高校などで教員として、または人文系博物館での学芸員として活躍しています。

　近年では広くアジア地域を射程においた先史・古代文化交流史など最前線の歴史研究を組み込み、國學院ならではの多彩な独自の研究分野を積極的に開拓しています。また、所定の科目を履修することで「考古調査士」の資格を取得することができます。

　◆専攻分野　　　　　　　　◆授与学位
　　　日本史学　　　　　　　　　修士(歴史学) ／ 博士(歴史学)
　　　外国史学
　　　考古学
　　　美学美術史
　　　博物館学